| 高粱全基因组内含子标记的开发 |
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| 引用本文： | 刘海岚.高粱全基因组内含子标记的开发[J].核农学报,2012,26(8). |
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| 作者姓名： | 刘海岚 |
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| 作者单位： | 四川农业大学玉米研究所,四川成都611130 农业部西南玉米生物学与遗传育种重点实验室,四川成都611130 |
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| 摘 要： | 通过分析已公布的658个随机挑选的SSR标记在12个高粱属材料中的多态性信息,发现基因中内含子标记较非内含子标记有更高的多态性,因此,本研究利用生物信息学方法进行了高粱全基因组内含子标记的开发。首先,对高粱29448条CDS序列进行内含子位点挖掘,找到115545个内含子位点。其次,在内含子两侧的序列上设计引物,经e-PCR在高粱基因组上筛选及定位,共获得82742个单拷贝内含子标记。其在染色体上数量变异范围为3794个（5号染色体）～15371个（1号染色体）之间,平均每条染色体上8237个。此外还构建了1个公共数据库（www.sicau.edu.cn/web/yms/sip/SIP.html）,以便研究人员下载及使用。
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| 关 键 词： | 高粱 内含子标记 SSR标记 遗传连锁图谱 |
DEVELOPMENT OF GENOME-WIDE INTRON POLYMORPHISM MARKERS IN Sorghum bicolor |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sorghum bicolor intron polymorphism marker SSR marker genetic linkage map |
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