| 基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 谢小燕,苏晓娜,王惠梅,江绍琳,吴建利,江绍玫.基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析[J].南方农业学报,2019,50(12):2638-2646. |
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| 作者姓名： | 谢小燕 苏晓娜 王惠梅 江绍琳 吴建利 江绍玫 |
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| 作者单位： | 江西财经大学艺术学院,南昌,330013江西农业大学南昌商学院,南昌,330013中国水稻研究所,杭州,310006江西农业大学农学院,南昌,330045江西财经大学统计学院,南昌,330013 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;转基因生物新品种培育科技重大专项 |
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| 摘 要： | 目的]筛选更优的ISSR-PCR扩增产物电泳检测方法,分析我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性,为建立和完善菰植物种质库及合理开发与利用菰资源提供理论依据.方法]挑选7条ISSR引物对华东地区9个野生菰居群104份材料基因组DNA进行PCR扩增,其ISSR-PCR产物分别采用2%琼脂糖凝胶电泳和5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测.结果]2%琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的多态性位点百分率(PPB)为63.49%、观测等位基因数(Na)为1.6349、有效等位基因数(Ne)为1.3012、Nei's基因多样性指数(He)为0.1871、Shannon's信息指数(I)为0.2908、居群间遗传分化系数(Gst)为0.3922、遗传相似系数(Gs)变化范围在0.8293~0.9775;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.885时,9个野生菰居群被分为两大类,SH(上海)和PYH(鄱阳湖)居群归为一类,其他7个居群归为另一类.5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的PPB为78.03%、Na为1.7803、Ne为1.2762、He为0.1804、I为0.2914、Gst为0.5086、Gs变化范围在0.7679~0.9837;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.850时,9个居群也被分为两大类,其中PYH居群单独为一类,其他8个居群归为另一类.结论]我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性丰富,居群间和居群内变异显著,基于ISSR分子标记的野生菰遗传多样性采用5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测可获得更可靠的遗传图谱,而2%琼脂糖凝胶电泳检测更适合早期的ISSR分子标记引物筛选.
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| 关 键 词： | 野生菰 ISSR分子标记 遗传多样性 琼脂糖凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶电泳 华东地区 |
Genetic diversity analysis of Zizania latifolia by ISSR in East China based on two electrophoresis detection methods |
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| XIE Xiao-yan,SU Xiao-na,WANG Hui-mei,JIANG Shao-lin,WU Jian-li,JIANG Shao-mei.Genetic diversity analysis of Zizania latifolia by ISSR in East China based on two electrophoresis detection methods[J].Journal of Southern Agriculture,2019,50(12):2638-2646. |
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| Authors: | XIE Xiao-yan SU Xiao-na WANG Hui-mei JIANG Shao-lin WU Jian-li JIANG Shao-mei |
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