沙棘PAL家族基因的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 吴亚楠 李贺 苏倩 王振铭 刘景 时一平 |
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作者单位: | 大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600;大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600;大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600;大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600;大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600;大连民族大学环境与资源学院 ,辽宁大连,116600 |
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基金项目: | 2017年度大连民族大学大学生创新训练项目 |
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摘 要: | 苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia lyase,PAL)是黄酮合成代谢途径中的关键酶,对植物中黄酮类物质的积累有重要的作用。为研究PAL家族基因及其编码蛋白的结构特征,本研究以前期获得的沙棘转录组测序数据为基础,通过功能注释与分析获得了3个PAL家族成员基因,分别命名为HrPAL1、HrPAL2和HrPAL3。生物信息学分析结果表明:沙棘PAL家族基因均含有完整的开放阅读框,编码以α-螺旋和无规卷曲为主要二级结构的亲水蛋白,其中HrPAL1是具有信号肽的分泌性蛋白。3种HrPAL蛋白在三级结构上有不同程度的相似性。
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关 键 词: | 沙棘 生物信息学 黄酮合成 关键酶基因 |
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