葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析 |
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作者姓名: | 苏玲 王鹏飞 杨阳 任凤山 王咏梅 陈万钧 |
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作者单位: | 山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100;山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100;山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100;山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100;山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100;山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室,山东 济南,250100 |
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基金项目: | 山东省农业重大应用技术创新资助项目;山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用资助项目 |
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摘 要: | 为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型、进化分析、染色体定位、基因结构、保守元件和基因表达模式。结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子。序列比对和系谱进化表明,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个组,Ⅱ组分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e五个亚组。染色体定位表明,存在串联复制和分布不均现象,但是在3号染色体上无该家族基因定位。结构域和保守元件分析都说明葡萄WRKY(VvWRKY)家族的WRKY结构域是高度保守的。葡萄叶片中基因表达模式分析表明,VvWRKY家族的部分基因参与非生物胁迫。
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关 键 词: | 葡萄 WRKY 转录因子 进化分析 表达分析 |
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