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猪流行性腹泻病毒CH/JLDH/2016株分离鉴定及S基因序列分析
作者姓名:曹东梅  张双  朱俊辉  郭梦茹  陆伟  刘岸  何浩  王开  胡桂学
作者单位:吉林农业大学动物科学技术学院;长春市朝阳区动物疫病预防控制中心;吉林市动物疫病预防控制中心;榆树市畜牧业管理局
摘    要:为了研究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的变异情况,试验采用分离病毒时添加胰蛋白酶的方法,从病死仔猪肠组织中成功分离鉴定出1株PEDV变异毒株,命名为CH/JLDH/2016,应用纳米巢式PCR法鉴定分离株,电镜负染观察,并对该分离株S基因序列特征和遗传进化关系进行分析。结果表明:经纳米巢式PCR扩增得到目的条带;在透射电子显微镜下可观察到完整的病毒粒子,具有冠状病毒典型结构;与现有疫苗株CV777相比,分离株S基因存在16处碱基的插入、10处碱基的缺失并伴有大量碱基突变,其推导的氨基酸序列存在5个氨基酸的插入和3个氨基酸的缺失;该分离株与疫苗株CV777处于不同分支,亲缘关系较远,而与近几年分离得到的PEDV变异毒株亲缘关系较近。说明PEDV呈现进化和变异趋势。

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