| 牛ASCL2基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王梦楠,吴茜红,赵姝君,王敬姣,李冬杰,李世杰. 牛ASCL2基因生物信息学分析[J]. 广西农业生物科学, 2013, 0(5): 645-651 |
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| 作者姓名： | 王梦楠 吴茜红 赵姝君 王敬姣 李冬杰 李世杰 |
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| 作者单位： | [1]河北农业大学生命科学学院,保定071001 [2]河北科技大学生物科学与工程学院,石家庄050018 |
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| 基金项目： | 基金项目：本研究由国家自然科学基金（31372312）和河北省自然基金项目（C2011204001）共同资助 |
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| 摘 要： | 在人与小鼠中，ASCL2基因是一个母源表达的印记基因，在早期胚胎和胎盘发育中起重要作用。牛ASCL2基因的印记状态和印记的分子机理还没有被研究。本研究采用生物信息学方法对牛ASCL2基因分子进化、启动子和CpG岛区域以及蛋白的高级结构进行分析和预测，为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础。对21种哺乳动物ASCL2基因的mRNA序列进化分析表明：这21种哺乳动物问的遗传距离小于0．536，且牛与猪遗传距离最小，为0．106，与基因进化树分析结果一致。CpG岛在线软件预测显示，在牛中，该基因上游5k序列中有三个CpG岛。启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示，启动子最可能位于该基因5’端上游4725--4775bp处CpG岛区域内，此区域包括大量潜在转录因子结合位点，并在4734bp处存在一个TATA框。蛋白质在线软件分析表明，ASCL2基因编码一种螺旋一环一螺旋形转录因子，有仅一螺旋、B一转角和无规则卷曲3种二级结构。
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| 关 键 词： | 牛 ASCL2基因 生物信息学 启动子 CpG岛 |
Bioinformatics Analysis of Bovine A SCL2 Gene |
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| Wang Mengnan WuXihong Zhao Shujun WangJingjiao Li Dongjie,Li Shijie. Bioinformatics Analysis of Bovine A SCL2 Gene[J]. Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science, 2013, 0(5): 645-651 |
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| Authors: | Wang Mengnan WuXihong Zhao Shujun WangJingjiao Li Dongjie Li Shijie |
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| Affiliation: | 1. 1 College of Life Science, Agricultural University of Hebei, Baoding, 071001; 2 Science and Technology, Hebei University of Science and Technol- ogy, Shijiazhuang, 050018 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bovine A SCL2 gene Bioinformatic analysis Promoter CpG islands |
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