梅山猪TAP1基因多态性及组织表达谱分析

本研究利用PCR-RFLP、Real-time PCR技术以及生物信息学方法,对梅山猪TAP1基因多态性、组织表达水平以及蛋白质保守功能域进行分析,旨在检测81头梅山猪中TAP1基因的多态性,并揭示其组织特异性表达规律,进一步探讨该基因的功能位点。结果表明:TAP1基因存在1个G729A突变,第243号甘氨酸未发生改变,并在梅山猪中检测出3种基因型(AA、AB和BB型);TAP1基因在肺、十二指肠、空肠等免疫组织和消化道中表达量较高,可能与肺部疾病和肠道疾病的抗性相关;同时保守域分析显示该蛋白N端发现具有4个跨膜区,中端有1个跨膜转运区域(ABC_membrane),位于183~454号氨基酸,C端有1个各种细胞活动相关的ATP酶保守域(AAA),位于526~715号氨基酸。本试验所检测的TAP1基因G729A发生在跨膜转运区域(ABC_membrane)内,可能对TAP1蛋白的跨膜转运功能造成一定的影响。