红麻SRAP-PCR反应体系优化及多态性引物的筛选

采用正交试验L16(43)设计,以dNTP、引物和Taq DNA聚合酶3种因素4个水平,并设置了8个模板DNA浓度梯度。扩增效果表明,红麻的SRAP-PCR最佳反应体系为2μL10×Taq Reaction Buffer、20ng模板DNA、dNTP 220μmol/L、引物0.35μmol/L、Taq DNA聚合酶0.5U,总体积为20μL。同时对256对SRAP引物进行扩增,筛选出条带清晰、多态性较好的引物100对。该反应体系及100对多态性引物组合应用于今后红麻的遗传多样性、品种鉴定、亲缘关系、遗传图谱构建、QTL定位等研究。