| 大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 宋仙萍,赵琳,张彦威,卢清瑶,谷月娇,李文滨.大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析[J].大豆科学,2012,31(6). |
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| 作者姓名： | 宋仙萍 赵琳 张彦威 卢清瑶 谷月娇 李文滨 |
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| 作者单位： | 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室,东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨150030 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，转基因生物新品种培育科技重大专项 |
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| 摘 要： | 利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA (34-106)和GRAS(158-513)2个结构域.氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响.
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| 关 键 词： | 大豆 GAI基因 DELLA结构域 GRAS结构域 |
Bioinformatics Analysis of GmGAI Homologous Gene in Soybean Genome |
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| SONG Xian-ping
,
ZHAO Lin
,
ZHANG Yan-wei
,
LU Qing-yao
,
GU Yue-jiao
,
LI Wen-bin.Bioinformatics Analysis of GmGAI Homologous Gene in Soybean Genome[J].Soybean Science,2012,31(6). |
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| Authors: | SONG Xian-ping ZHAO Lin ZHANG Yan-wei LU Qing-yao GU Yue-jiao LI Wen-bin |
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