| 大豆脂肪酸Fad3a基因HRM检测体系优化研究 |
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| 引用本文： | 武林,王艳,孙梦阳,赵雪,韩英鹏,滕卫丽,李文滨. 大豆脂肪酸Fad3a基因HRM检测体系优化研究[J]. 大豆科学, 2012, 31(6) |
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| 作者姓名： | 武林 王艳 孙梦阳 赵雪 韩英鹏 滕卫丽 李文滨 |
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| 作者单位： | 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室,东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨150030 |
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| 基金项目： | 农业部大豆产业技术体系,国家十二五科技支撑计划课题,国家重点基础研究发展计划973计划前期项目,国家自然科学基金项目,中国博士后项目,黑龙江省博士后项目,黑龙江省骨干教师项目 |
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| 摘 要： | 高分辨率熔解曲线分析法可准确检测单核苷酸多态性,具有稳定性和高效性的特点.建立基于HRM的SNP检测方法,确立最佳的反应体系和反应条件是后续基因分型研究的前提和基础.Fad3a基因为大豆脂肪酸合成的关键酶基因,以Fad3a基因为研究对象,通过测序获得大豆品种合丰25(亚麻酸含量5.94％)和L-5(亚麻酸含量2.75％)在Fad3a基因序列上的单核苷酸多态性位点,根据这2个品种的Fad3a基因测序结果,利用Lighter scanner primer design软件设计产物长度不同的SNP突变引物5对,探索PCR产物长度和不同的退火温度对HRM分型结果的影响.结果表明:HRM分型的扩增子适宜长度应小于150 bp,且在扩增成功的基础上使用相对较高的退火温度可使待测PCR产物熔解峰单一,熔解曲线平稳.
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| 关 键 词： | 大豆 Fad3a SNP HRM体系优化 |
Optimization of High Resolution Melting Analysis System for Fad3a Gene of Soybean Fatty Acid |
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| WU Lin , WANG Yan , SUN Meng-yang , ZHAO Xue , HAN Ying-peng , TENG Wei-li , LI Wen-bin. Optimization of High Resolution Melting Analysis System for Fad3a Gene of Soybean Fatty Acid[J]. Soybean Science, 2012, 31(6) |
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| Authors: | WU Lin WANG Yan SUN Meng-yang ZHAO Xue HAN Ying-peng TENG Wei-li LI Wen-bin |
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