耧斗菜WRKY转录因子家族生物信息学分析及抗盐基因筛选

为挖掘耧斗菜属植物WRKY的抗盐基因奠定理论基础，通过转录组数据分析，鉴定WRKY转录因子，并对家族成员进行生物信息学分析。结合表达模式对其功能进行分析，结果表明：从欧耧斗菜中鉴定出35个WRKY转录因子，根据WRKY七肽的数量和锌指结构特点可分为3亚族，每组成员分别有8、24、3个；其编码蛋白质氨基酸数为173～797个，分子量为19 902.13～87 973.25,均为亲水性蛋白，其中有1个稳定蛋白；亚细胞定位结果均在细胞核中。结合系统进化树，从14个差异显著表达的AvWRKY基因中，筛选出与已知抗盐的WRKY基因亲缘关系近的4个基因(AvWRKY3、AvWRKY7、AvWRKY16、AvWRKY34),作为在耧斗菜响应盐胁迫中发挥重要作用的候选基因。