基于RNA-Seq数据分析油酸对牛前体脂肪细胞分化及PPAR信号通路的影响 |
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引用本文: | 金哲勇,张军芳,唐琳,李强,金鑫.基于RNA-Seq数据分析油酸对牛前体脂肪细胞分化及PPAR信号通路的影响[J].吉林农业大学学报,2023(2):221-227. |
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作者姓名: | 金哲勇 张军芳 唐琳 李强 金鑫 |
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作者单位: | 1. 延边大学实验动物中心;2. 东北寒区肉牛科技创新教育部工程研究中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31660667); |
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摘 要: | 利用100μmol/L油酸对细胞进行诱导分化,通过RNA-Seq技术对分化后48,96 h的细胞进行转录组测序,对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果表明:与分化48 h时相比,分化96 h时差异表达基因数增加3 519个,差异表达基因的分子功能、参与的生物过程和细胞组成随分化时间不同均发生变化,生化代谢途径和信号转导途径也差异较大;由过氧化物酶体增殖物激活受体(Peroxisome proliferatorsactivated receptors,PPARs)信号通路的分析结果可以得出,分化48 h时,PPARγ的表达上调,信号通路成员PLIN2、CPT1β,SREBP1、FABP4上调,SCD表达下调;分化96 h时,PLIN2、SREBP1、CPT1β显著上调,PPARγ、SCD的表达显著下调,FABP4表达无显著变化。说明油酸对延边牛前体脂肪细胞分化过程中的转录组学及信号通路存在一定影响。
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关 键 词: | 延边牛 油酸 转录组学 前体脂肪细胞 PPAR信号通路 |
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