| 基于EST和GSS序列的木豆miRNA生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李崇奇,;周鹏,;蔡望伟. 基于EST和GSS序列的木豆miRNA生物信息学分析[J]. 安徽农学通报, 2014, 0(10): 17-19 |
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| 作者姓名： | 李崇奇, 周鹏, 蔡望伟 |
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| 作者单位： | [1]海南医学院生物化学与分子生物学教研室,海南海口571199; [2]中国热带农业科学院热带生物技术研究所分析测试中心,海南海口571101; [3]海南大学农学院,海南海口570228 |
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| 基金项目： | 海南省研究生创新科研课题（Hyb2012-2）;海南医学院科研培育基金（HY2013-18）. |
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| 摘 要： | 应用miRtour在线分析工具对木豆EST和GSS序列进行miRNA生物信息学预测，应用psRNATarget进行靶基因预测。结果发现，43条不同的木豆miRNA成熟序列，隶属于33个不同的miRNA家族。靶基因预测发现有36条编码序列受miRNA调控，其中17条序列编码酶，2条编码转录因子，7条编码参与细胞信号转导的蛋白，5条编码参与蛋白质降解通路的蛋白。
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| 关 键 词： | 木豆 miRNA EST GSS |
Identification of microRNA in Cajanus cajan based on EST and GSS Sequences |
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| Affiliation: | Li Chongqi , et al. (1Department of Biochemistry and molecular biology, Hainan Medical College, Haikou 571199, China; 2.Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology/Analysis ＆ Testing Center, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou 571101, China; 3College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cajanus ca jan miRNA EST GSS |
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