首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析
作者姓名:唐月异  张建成  王秀贞  崔凤高  王传堂
作者单位:1. 山东省花生研究所,山东,青岛,266100;中国海洋大学,山东,青岛,266003
2. 山东省花生研究所,山东,青岛,266100
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金,科技部863项目,山东省科技发展计划项目,山东省农科院高新技术创新基金,山东省农科院青年基金,山东省自然科学基金 
摘    要:下载GenBank数据库中已公布的花生栽培种基因组DNA序列1718条及EST序列85797条,利用DNAStar软件进行叠连群构建,基因组DNA序列构建叠连群161个,长度共计152940bp,直接鉴定出候选SNP位点5496个,SNP平均出现频率为3.59%;EST序列构建10990个叠连群,长度共计10477241bp,由三条及三条序列以上构成的叠连群的总长度为6524329bp,发现候选SNP位点307179个,SNP平均出现频率为4.71%。

关 键 词:花生  SNP  频率  GenBank
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号