| GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析 |
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| 引用本文： | 唐月异,张建成,王秀贞,崔凤高,王传堂.GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析[J].花生学报,2010,39(2):21-23. |
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| 作者姓名： | 唐月异 张建成 王秀贞 崔凤高 王传堂 |
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| 作者单位： | 1. 山东省花生研究所,山东,青岛,266100;中国海洋大学,山东,青岛,266003
2. 山东省花生研究所,山东,青岛,266100 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金，科技部863项目，山东省科技发展计划项目，山东省农科院高新技术创新基金，山东省农科院青年基金，山东省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 下载GenBank数据库中已公布的花生栽培种基因组DNA序列1718条及EST序列85797条,利用DNAStar软件进行叠连群构建,基因组DNA序列构建叠连群161个,长度共计152940bp,直接鉴定出候选SNP位点5496个,SNP平均出现频率为3.59%;EST序列构建10990个叠连群,长度共计10477241bp,由三条及三条序列以上构成的叠连群的总长度为6524329bp,发现候选SNP位点307179个,SNP平均出现频率为4.71%。
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| 关 键 词： | 花生 SNP 频率 GenBank |
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