云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析 |
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引用本文: | 刘树芳,张先闻,董丽英,刘沛,田维逵,周伍民,杨勤忠.云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析[J].中国农学通报,2023(12):123-130. |
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作者姓名: | 刘树芳 张先闻 董丽英 刘沛 田维逵 周伍民 杨勤忠 |
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作者单位: | 1. 云南省农业科学院农业环境资源研究所/云南省农业跨境有害生物绿色防控重点实验室;2. 云南大学农学院 |
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摘 要: | 为了解稻瘟病菌的群体遗传结构,选用13对SSR标记对2007—2013年分离自云南省陆稻区、籼稻区和粳稻区(共计13个州)的125个稻瘟病菌单孢菌株的全基因组DNA进行PCR扩增及分析,结果13对引物共检测出128个等位基因;聚类分析表明,在相似系数为0.57时,125个供试菌株可划分为29个遗传宗谱,优势宗谱YN02包含了39个菌株,占总菌株数的31.20%,次优势宗谱YN08包含了15个菌株,占总菌株数的12.00%,其余71个菌株分属27个宗谱;表明云南省既有优势宗谱,又有较多遗传多样性的小宗谱,菌株群体遗传多样性丰富;比较不同稻区菌株群体的宗谱频率发现,陆稻区菌株的宗谱频率为65.52%,粳稻区和籼稻区菌株的宗谱频率分别为27.59%和13.79%,表明陆稻区菌株群体的遗传结构比粳稻区、籼稻区菌株复杂。因此,针对菌株群体宗谱较少,且优势宗谱突出的地方,应加强品种多样化种植,有利于稻瘟病菌群体的稳定化选择,降低病害流行风险。
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关 键 词: | 水稻 稻瘟病菌 SSR标记 遗传结构 宗谱 |
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