广西番茄花叶病毒和番茄褪绿病毒的分子鉴定 |
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引用本文: | 李战彪,莫翠萍,陈锦清,秦碧霞,崔丽贤,谢慧婷,蒋雅琴,汤亚飞,蔡健和.广西番茄花叶病毒和番茄褪绿病毒的分子鉴定[J].中国农学通报,2023(28):92-98. |
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作者姓名: | 李战彪 莫翠萍 陈锦清 秦碧霞 崔丽贤 谢慧婷 蒋雅琴 汤亚飞 蔡健和 |
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作者单位: | 1. 广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广西作物病虫害生物学重点实验室;2. 广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所;3. 广东省农业科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室 |
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摘 要: | 为明确引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病毒病原,采集4个疑似病毒感染的番茄样品,利用小RNA深度测序、RT-PCR、序列分析、遗传进化树的构建等方法对样品进行鉴定及遗传进化分析。研究结果发现,小RNA数据中的41条contigs分别被注释为番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)和番茄褪绿病毒(tomato chlorosis virus,ToCV);RT-PCR证实了s RNA的结果,且所有样品均存在ToMV和To CV的复合侵染。通过拼接获得ToMV和ToCV RNA2的近全基因序列,ToMV近全基因序列为6383 bp,命名为ToMV-GX;ToCV RNA2的近全基因序列为8031 bp,命名为ToCV-GX。进化树分析发现,本研究获得的ToMV-GX与ToMV中国山西、内蒙古、呼和浩特3个分离物处于一个分支,说明其具有较近的亲缘关系;ToCV-GX与ToCV中国台湾、广东分离物处于一个大分支,说明具有较近的亲缘关系。上述结果证实,引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病原是To MV和ToCV,本研究是ToMV和ToCV复合侵染广西番茄的首次报道。
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关 键 词: | 番茄花叶病毒 番茄褪绿病毒 广西 小RNA深度测序 遗传进化分析 |
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