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菊花枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性比较
引用本文:赵娅红,吴治兴,刘敏荣,涂艳芳,薛建平,王悦,卢超,刘佳妮,余磊,姚茹瑜,陈志星,黄飞燕.菊花枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性比较[J].中国农学通报,2023(13):109-116.
作者姓名:赵娅红  吴治兴  刘敏荣  涂艳芳  薛建平  王悦  卢超  刘佳妮  余磊  姚茹瑜  陈志星  黄飞燕
作者单位:1. 昆明学院农学与生命科学学院/云南省都市特色农业工程技术研究中心;2. 昆明虹之华园艺有限公司;3. 开远市农业技术推广中心;4. 云南农业职业技术学院
基金项目:昆明市科技计划项目“昆明市昆明虹之华园艺有限公司科技创新团队及企业科技创新中心”(2022-RCC-CXTD-3,2022-CGC-CXZX-3);;云南省教育厅科学研究基金项目“黑胫病菌胁迫下烟草microRNA的高通量测序及生物信息学分析”(2022Y708);
摘    要:菊花枯萎病(Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi)是目前影响菊花产业发展的一种侵入土壤根部传播的病害。笔者利用Illumina MiSeq高通量测序技术探讨菊花患枯萎病的发病植株和菊花健康植株的土壤根际微生物群落结构的差异。结果表明,菊花枯萎病的发生对根际土菌落丰富度存在明显影响。健康菊花植株和患病菊花植株根际细菌OTU数分别是1831和1723个,两者共有为1661个,菊花健株根际土壤中细菌OTU总数比菊花病株增加6.23%,特有OTUs数是患病植株的2.74倍。从土壤根际群落结构的多样性水平上看,菊花患枯萎病植株低于菊花健康植株。Alpha多样性指数显示,菊花病株根际土壤的Shannon、Ace以及Chao1指数比健株降低1.60%、5.71%和6.62%。此外,菊花患枯萎病植株与健康植株在土壤细菌群落多样性的结构上也有明显差异,菊花健康植株根际土中,主要α-变形菌纲(α-proteobacteria)、芽孢杆菌纲(Bacilli)、绿弯菌纲(Chloroflexia),其相对丰富度分别比病株高10.27%、1.51%、9.54%;在属水平上...

关 键 词:菊花  根际土壤  高通量测序  微生物  细菌群落
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