水稻DUF760基因家族的全基因组鉴定与表达谱分析 |
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引用本文: | 杜强,韩玲玲,肖秀文,李锦程,沈梦宇,王志龙,陈秋红.水稻DUF760基因家族的全基因组鉴定与表达谱分析[J].华北农学报,2023(1):1-8. |
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作者姓名: | 杜强 韩玲玲 肖秀文 李锦程 沈梦宇 王志龙 陈秋红 |
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作者单位: | 湖南农业大学农学院水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室作物基因工程湖南省重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31401699);;长沙市自然科学基金项目(kq2014065); |
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摘 要: | 为了探索DUF760基因家族在水稻生长发育中的潜在功能,对水稻DUF760基因家族进行了全基因组鉴定、分类、启动子序列分析和表达谱分析。通过生物信息学技术在水稻和拟南芥中分别鉴定了6,8个DUF760家族成员。系统进化树分析将这些家族成员分成2个亚家族,二者在蛋白保守基序和基因结构上也存在一些特征差别。水稻DUF760家族基因启动子区域存在多个响应逆境胁迫和植物激素的顺式作用元件,ABRE(脱落酸响应)元件存在于家族所有成员的启动子序列中,OsDUF760-1启动子区域拥有9个脱落酸(ABA)相关的响应元件。在ABA处理水稻后,OsDUF760-1的转录表达水平显著下调,而OsDUF760-3显著上调,二者在干旱胁迫处理水稻后的表达变化模式与ABA处理水稻后的表达变化模式一致,说明这2个基因可能通过ABA信号途径参与水稻干旱胁迫响应,并且扮演不同的角色。除对ABA和干旱胁迫处理具有较强响应外,水稻DUF760家族成员还对JA(茉莉素)、低温及稻瘟菌处理具有较强的响应表达变化。
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关 键 词: | 水稻 DUF760基因家族 逆境 植物激素 表达谱分析 |
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