柑橘抗逆基因MYB96的克隆与表达分析 |
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引用本文: | 李潇,郭文芳,杨莉,胡威,匡柳青,刘德春,刘勇.柑橘抗逆基因MYB96的克隆与表达分析[J].华北农学报,2023(2):57-64. |
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作者姓名: | 李潇 郭文芳 杨莉 胡威 匡柳青 刘德春 刘勇 |
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作者单位: | 江西农业大学农学院 |
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摘 要: | 为了探讨柑橘MYB96基因在柑橘抗逆过程中的作用,以甜橙、柠檬、金柑、芦柑为试验材料,克隆得到4个柑橘MYB转录因子家族基因,分别命名为CsMYB96、ClMYB96、FmMYB96、CrMYB96,并对其生物信息学以及不同非生物胁迫处理下的表达模式进行分析。结果表明,CsMYB96、ClMYB96、FmMYB96和CrMYB96的开放阅读框长度分别为1 032,1 035,1 035和1 032 bp,其编码的蛋白分别由343,344,344,343个氨基酸组成,分子量分别约为38.16,38.27,38.22,38.13 ku,等电点分别为6.31,6.35,6.35,6.31,均为不稳定亲水性蛋白;亚细胞定位预测结果均定位于细胞核。这4个基因编码的蛋白二级结构相似,主要由α螺旋和无规卷曲构成;具有高度保守的R2和R3结构域;在进化关系上,与克莱门氏小柑橘CcMYB96亲缘关系最近。CsMYB96基因的启动子中含有脱落酸响应元件(ABRE)、低温响应元件(LTR)、厌氧响应元件(ARE)、参与干旱诱导的MYB结合位点(MBS)等非生物胁迫响应相关顺式作用元件。qRT-PCR结果分析...
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关 键 词: | 柑橘 MYB96 生物信息学分析 非生物胁迫 表达分析 |
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