江西铅山红芽芋芋病毒种类lncRNA测序鉴定及其序列分析 |
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作者姓名: | 尹明华 江玲 姚慧婷 宋粤涛 王梦晴 王沛棋 张艺欣 |
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作者单位: | 1. 上饶师范学院生命科学学院;2. 上饶农业技术创新研究院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目“江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒抑制细胞凋亡抗早衰的机理研究”(32060092),“江西铅山红芽芋“超低温疗法脱毒”响应机制的研究”(31960079);;江西省教育厅科学技术研究项目“江西铅山红芽芋WUSCHEL-related homeobox、CLAVATA和AGAMOUS基因cDNA全长克隆、序列信息和功能分析”(GJJ211729); |
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摘 要: | 探究江西铅山红芽芋的主要病毒种类及其序列信息,为其脱毒苗培育提供依据。采用lncRNA测序技术确定江西铅山红芽芋的病毒种类,并利用RT-PCR技术、生物信息学分析软件和qRT-PCR技术进行病毒验证、序列分析和组织表达分析。江西铅山红芽芋检测到芋花叶病毒(DsMV)和花椰菜花叶病毒(CaMV)两种病毒;DsMV和CaMV基因cDNA总长度分别为1780 bp和5412 bp,分别编码592和1803个氨基酸;DsMV和CaMV多聚蛋白二级结构均由α螺旋、β-片层、无规则卷曲构成,其三级结构均为单体蛋白;DsMV和CaMV在江西铅山红芽芋根、茎、叶中均有侵染,但均在叶中表达量最高。明确了侵染江西铅山红芽芋的主要病毒种类,并首次在江西铅山红芽芋上检测到CaMV。
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关 键 词: | 江西铅山红芽芋 病毒种类鉴定 lncRNA测序 芋花叶病毒 花椰菜花叶病毒 序列分析 |
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