广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定 |
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引用本文: | 龚明霞,赵虎,王萌,吴星,赵曾菁,何志,黄金梅,孟生德,王日升.广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定[J].园艺学报,2022(5):1060-1072. |
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作者姓名: | 龚明霞 赵虎 王萌 吴星 赵曾菁 何志 黄金梅 孟生德 王日升 |
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作者单位: | 1. 广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所广西蔬菜育种与新技术研究重点实验室;2. 甘肃省敦煌种业集团股份有限公司 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32060687);;广西科技重大专项(桂科AA17204026);;广西自然科学基金项目(2019 GXNSFAA 185039); |
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摘 要: | 采用小RNA(sRNA)深度测序技术,结合RT-PCR技术对广西9个辣椒主产区具有典型病毒病症状的病样进行检测,共发现10种病毒,其中小米椒内源RNA病毒1(Capsicum frutescens endornavirus 1,CFEV 1)、辣椒潜隐病毒2(pepper cryptic virus 2,PCV 2)、烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和辣椒黄脉病毒(pepper vein yellows virus,PeVYV)是在广西辣椒上首次发现,且CFEV 1在中国是首次发现。10种病毒在75份辣椒病样中的总检出率为8.00%~66.67%,前5位依次为辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV,66.67%)、甜椒脉斑驳病毒(pepper veinal mottle virus,PVMV,62.67%)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV,41.33%)、CFEV 1(32.0%)以及PCV 2(26.67%)。ChiVMV、PVMV、CMV和C...
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关 键 词: | 辣椒 病毒病 小RNA 深度测序 RT-PCR 分子鉴定 |
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