| 长江中游常见鱼类DNA条形码研究及其电子芯片分析 |
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| 引用本文： | 郜星晨,姜 伟,刘绍平. 长江中游常见鱼类DNA条形码研究及其电子芯片分析[J]. 渔业科学进展, 2019, 40(5): 89-100 |
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| 作者姓名： | 郜星晨 姜 伟 刘绍平 |
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| 作者单位： | 中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室 宜昌443100;农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站 中国水产科学研究院长江水产研究所 武汉 430223 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划“典型脆弱生态修复与保护研究”重点专项(2016YFC0502210)和农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测站共同资助 |
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| 摘 要： | 为建立长江中游常见鱼类的快速鉴别方法,文献调研了7目11科50属64种鱼类名录,GenBank共获取168条线粒体细胞色素c氧化酶I (COⅠ)序列,分析了序列特征、不同阶元Kimura-2-paramater(K2P)遗传距离及系统进化关系。结果显示,64种鱼类的种间遗传距离(平均值为0.084)明显大于种内(平均值为0.0079),NJ树上不同物种均能以较高支持度聚类成独立分支,以线粒体COⅠ序列作为DNA条形码可准确鉴定所研究鱼类;综合利用分子生物学软件筛选物种特异性探针,最终43种鱼类可筛选出112条物种特异性探针,物种识别率为67.2%。本研究验证了DNA条形码芯片技术在长江中游鱼类物种鉴定的可行性,可为该地区鱼类物种多样性保护提供技术支持。
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| 关 键 词： | 长江中游 DNA条形码 电子芯片 |
| 收稿时间： | 2018-06-24 |
| 修稿时间： | 2018-07-28 |
DNA Barcoding and Electronic Microarrays for Common Fish Species in the Middle Reaches of the Yangtze River |
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| GAO Xingchen,JIANG Wei and LIU Shaoping. DNA Barcoding and Electronic Microarrays for Common Fish Species in the Middle Reaches of the Yangtze River[J]. Progress in Fishery Sciences, 2019, 40(5): 89-100 |
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| Authors: | GAO Xingchen JIANG Wei LIU Shaoping |
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| Affiliation: | Chinese Sturgeon Research Institute, China Three Gorges Corporation, Hubei Key Laboratory of Three Gorges Project for Conservation of Fishes, Yichang 443100,Chinese Sturgeon Research Institute, China Three Gorges Corporation, Hubei Key Laboratory of Three Gorges Project for Conservation of Fishes, Yichang 443100 and Scientific Observing and Experimental Station of Fishery Resources and Environment in the Upper and Middle Reaches of Yangtze River, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yangtze River Fishery Resources Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Middle reaches of Yangtze River DNA barcode Electronic microarray |
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