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禽流感病毒A/Turkey/Canada/63毒株HA和NA基因的克隆及序列分析
引用本文:潘蔚绮 刘明 刘春国 张云 杨涛. 禽流感病毒A/Turkey/Canada/63毒株HA和NA基因的克隆及序列分析[J]. 中国兽医科技, 2006, 36(8): 611-616
作者姓名:潘蔚绮 刘明 刘春国 张云 杨涛
作者单位:[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001 [2]东北农业大学动物医学院,黑龙江哈尔滨150030
基金项目:国家“十五”科技攻关计划项目(2004BA519A19);黑龙江省科技攻关项目(GD04B801-01)
摘    要:用SPF鸡胚增殖禽流感病毒(AIV)A/Turkey/Canada/63毒株,提取病毒基因组总RNA,应用RT-PCR技术分别扩增该病毒分离株的HA和NA基因全片段,并克隆到pMD18-T载体上。测序结果表明,该毒株的HA基因全长为1745bp,含有完整的阅读框架,编码566个氨基酸;NA基因全长1467bp,编码469个氨基酸。BLAST序列比较结果显示,该毒株HA基因属于H6亚型,NA基因属于N2亚型。将获得的HA和NA基因与AIV数据库中H6和N2基因进行遗传演化分析,表明该毒株HA基因与其他H6基因核苷酸的同源性为80.5%~87.3%,氨基酸的同源性为88.0%~93.1%;NA基因与其他N2基因核苷酸的同源性为86.0%~93.5%,氨基酸的同源性为90.6%~96.3%。

关 键 词:禽流感病毒 H6N2亚型 HA基因 NA基因 序列分析
文章编号:1673-4696(2006)08-0611-06
收稿时间:2006-02-15
修稿时间:2006-05-09

Cloning and sequencing of HA and NA genes of avian influenza virus strain A/Turkey/Canada/63
PAN Wei-qi, LIU Ming, LIU Chun-guo, ZHANG Yun, YANG Tao. Cloning and sequencing of HA and NA genes of avian influenza virus strain A/Turkey/Canada/63[J]. Chinese Journal of Veterinary Science and Technology, 2006, 36(8): 611-616
Authors:PAN Wei-qi   LIU Ming   LIU Chun-guo   ZHANG Yun   YANG Tao
Abstract:
Keywords:avian influenza virus   H6N2 subtype   HA   NA   sequence analysis
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