| 百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析 |
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| 引用本文： | 邹梦雯,岳建华,张荻,申晓辉. 百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析[J]. 上海交通大学学报(农业科学版), 2015, 0(3): 36-42, 52 |
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| 作者姓名： | 邹梦雯 岳建华 张荻 申晓辉 |
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| 作者单位： | 上海交通大学农业与生物学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31300580,5);中国博士后科学基金特别资助项目(2013T60451) |
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| 摘 要： | 采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法获得百子莲生长素受体TIR1基因cDNA全长序列,对该序列进行生物信息学分析的结果显示,TIR1基因的mRNA序列全长为2 235bp;5’非编码区296bp,3’非编码区172bp;该基因的ORF全长为1 764bp,编码一个含有588个氨基酸的蛋白。百子莲TIR1推导蛋白序列与葡萄(Vitis vinifera)、二穗短柄草(Brachypodium distachyon)、高粱(Sorghum bicolor),玉米(Zea mays)等植物均具有较高的同源性,同源性最高的是葡萄,可达78%。系统进化树表明,百子莲与葡萄距离最近。由α-螺旋,随机卷曲和延伸链组成一个磁状结构,为亲水蛋白,疏水性值为-0.092,在百子莲体细胞胚胎发生过程中,实时荧光定量PCR结果表明TIR1基因表达量在愈伤组织中含量最低,在胚性愈伤组织和体细胞胚胎中含量均有所升高,而在体胚幼苗中表达量最高,表明该基因介导的生长素信号在体细胞胚胎发生过程中发挥着非常重要的作用。
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| 关 键 词： | 百子莲 生长素受体基因 TIR1 克隆 基因表达 |
| 收稿时间： | 2014-08-29 |
Cloning and Functional Analysis of Full-Length cDNA of the Auxin Receptor Gene TIR1 from Agapanthus praecox ssp.orientalis |
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| ZOU Meng-wen,YUE Jian-hu,ZHANG Di and SHEN Xiao-hui. Cloning and Functional Analysis of Full-Length cDNA of the Auxin Receptor Gene TIR1 from Agapanthus praecox ssp.orientalis[J]. Journal of Shanghai Jiaotong University (Agricultural Science), 2015, 0(3): 36-42, 52 |
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| Authors: | ZOU Meng-wen YUE Jian-hu ZHANG Di SHEN Xiao-hui |
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| Affiliation: | School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China and School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Agapanthus praecox ssp.orientalis TIR1 auxin receptor gene cloning gene expression |
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