| 鲢三、四核苷酸重复微卫星标记的筛选及其特征分析 |
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| 引用本文： | 谭照君,张天奇,鲁翠云,李 超,孙效文.鲢三、四核苷酸重复微卫星标记的筛选及其特征分析[J].上海海洋大学学报,2011,20(3):328-335. |
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| 作者姓名： | 谭照君 张天奇 鲁翠云 李 超 孙效文 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学 生命科学与技术学院;大连海洋大学 生命科学与技术学院;中国水产科学研究院 黑龙江水产研究所;中国水产科学研究院 黑龙江水产研究所;中国水产科学研究院 黑龙江水产研究所 |
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| 基金项目： | 国家973重大基础研究发展计划（2004CB117405） |
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| 摘 要： | 通过磁珠富集法筛选鲢(Hypophthalmichtys molitrix)的三、四核苷酸重复微卫星分子标记。提取鲢血液大片段基因组DNA，用限制性内切酶Sau3AI进行酶切，蔗糖密度梯度离心收集400~900 bp长度的片段，构建鲢全基因组PCR文库，用生物素标记的微卫星探针(TGA)8、(CAG)8以及(AGAT)6进行筛选，磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段，获得含有微卫星的单链序列；将这些序列通过PCR扩增，连接pMD 18-T载体，转入感受态大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α，获得微卫星文库；再用γ-32P标记的放射性同位素探针进行二次杂交筛选，获得1 758个阳性克隆，选择测序348个克隆序列中，共含有280个微卫星座位，其中完美型167个(59.64%)，非完美型28个(10%)，混合型85个(30.36%)。Primer 3.0软件设计60对引物，并用珠江水系的野生鲢群体对引物进行多态性位点检测。统计软件分析显示其中22对具有较高的筛选效率和多态性，可作为鲢种质评价等遗传分析的工具。
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| 关 键 词： | 鲢 微卫星 三核苷酸和四核苷酸重复序列 |
Development and characteristics of tri- and tetra- nucleotide microsatellites for silver carp (Hypophthalmichtys molitrix) |
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| TAN Zhao-jun,ZHANG Tian-qi,LU Cui-yun,LI Chao and SUN Xiao-wen.Development and characteristics of tri- and tetra- nucleotide microsatellites for silver carp (Hypophthalmichtys molitrix)[J].Journal of Shanghai Ocean University,2011,20(3):328-335. |
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| Authors: | TAN Zhao-jun ZHANG Tian-qi LU Cui-yun LI Chao and SUN Xiao-wen |
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| Keywords: | Hypophthalmichtys molitrix microsatellite tri- and tetra- nucleotide microsatellites |
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