三角帆蚌AMP基因cDNA全序列的克隆及分子特征研究

以三角帆蚌（Hyriopsis cumingii）为研究材料，根据实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列, 利用RACE克隆了三角帆蚌AMP基因的cDNA全序列。该cDNA序列全长为970 bp，5′端非翻译区123 bp，3′端非翻译区526 bp，开放阅读框（ORF）长为300 bp，共编码99个氨基酸，包含一段由27个氨基酸组成的信号肽和72个氨基酸的成熟肽，分子量为10 924.7 u。氨基酸序列分析表明，该序列存在明显的跨膜结构和疏水区。同源性分析表明，该基因编码的蛋白与海兔（Aplysia californica）theromacin氨基酸序列的相似度最高为56%，而与贻贝等中发现的抗菌肽defensins、mytilins、myticins和mytimycins相似度较低，推测属于抗菌肽theromacin基因家族。Jpred3软件对三角帆蚌AMP蛋白的二级结构预测结果表明，在第2～22、57～62氨基酸残基处存在α螺旋，因此，三角帆蚌的AMP蛋白是包含跨膜螺旋的膜蛋白。为进一步研究该基因的表达、功能及三角帆蚌病害防御奠定了分子基础。

Full length cDNA cloning and molecular characteristic research of AMP gene in Hyriopsis cumingii