长江华溪蟹β-actin 基因cDNA扩增及分子系统发育初步分析

利用RT-PCR技术，扩增了长江华溪蟹(Sinopotamon yangtsekiense)β-actin基因片段，测序并结合GenBank数据库中蓝蟹（Callinectes sapidus）、中华绒螯蟹（E.sinensis）、黑背地蟹（Gecarcinus lateralis）、张口蟹（Neohelice granulata）、远海梭子蟹（Portunus pelagicus）、锯缘青蟹（Scylla serrata）6种蟹的同源序列进行比较。结果显示：在长为338 bp的β-actin同源序列中有115个变异位点，57个单碱基变化位点。7种蟹的种间核苷酸变异值从1.6％到25.3％，碱基替换比值从0.740到4.050，其中锯缘青蟹和远海梭子蟹亲缘关系很近，长江华溪蟹和地蟹、张口蟹亲缘关系较远，而中华绒螯蟹和远海梭子蟹关系较远。用NJ法和ML法构建了分子系统树，得到了相同的拓扑结构。系统发育分析表明长江华溪蟹单独形成一支，与其它海洋蟹的亲缘关系远，支持溪蟹单独划分总科。锯缘青蟹和远海梭子蟹先聚在一起，然后和黑背地蟹聚在一起，再和弓蟹科的张口蟹聚在一起，与传统形态学分类系统稍有不同。