| pep_pattern.pl,搜索蛋白质序列模体的Perl脚本 |
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| 作者姓名： | 李旭凯 彭良才 王令强 |
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| 作者单位： | 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/华中农业大学生物质与生物能源中心/华中农业大学植物科学技术学院，武汉430070;华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/华中农业大学生物质与生物能源中心/华中农业大学植物科学技术学院，武汉430070;华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/华中农业大学生物质与生物能源中心/华中农业大学植物科学技术学院，武汉430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（30900890，31171524）、全国博士后基金项目（20070420917）、湖北省自然科学基金项目（2009CDB324）和中央高校基本科研业务费专项（2011PY047） |
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| 摘 要： | 用Perl语言编写了一个pep_pattern.pl脚本,可从一组相关序列中搜索非常相似的序列片段,通过匹配所有可能的氨基酸片段的排列,统计每个匹配模体在序列中的出现频率和位置,搜索蛋白质序列中的2~4个多肽的模体。
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| 关 键 词： | pep_pattern.pl Perl脚本 蛋白质序列 模体 排列 |
| 收稿时间： | 2013-05-27 |
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