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| 凡纳滨对虾Arf6基因的克隆及表达分析 | |
| 引用本文： | 崔亮,殷勤,陈晓汉,彭金霞,王志伟,李奎. 凡纳滨对虾Arf6基因的克隆及表达分析[J]. 渔业科学进展, 2011, 32(2): 60-65 |
| 作者姓名： | 崔亮 殷勤 陈晓汉 彭金霞 王志伟 李奎 |
| 作者单位： | 1. 广西大学,南宁530021;广西壮族自治区水产研究所,南宁530021 2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193 3. 广西壮族自治区水产研究所,南宁,530021 |
| 基金项目： | 国家科技支撑计划项目，国家虾产业技术体系岗位专家，广西应用基础研究专项，广西自然科学基金，和广西研究生教育创新计划资助项目 |
| 摘 要： | 通过电子克隆所得序列设计引物,采用PCR扩增方法首次克隆得到长695bp的凡纳滨对虾Arf6基因序列,其中包括96bp的5'非翻译区(Untranslated region,UTR)、71bp的3'非翻译区和528bp的开放阅读框.编码175个氨基酸残基,推算分子量约为20kDa,理论等电点为8.82,分子式为C896H1426N252O255S8.氨基酸序列分析表明,Arf6基因编码的氨基酸序列中具有保守的GTP结合区域,总的带负电荷的残基(Asp+Glu)为21,总的带正电荷的残基(Arg+Lys)为25.与其他物种的Arf6基因进行同源比对发现,该基因的氨基酸序列具有较高的保守性,基于氨基酸序列的聚类分析表明,凡纳滨对虾与果蝇属种类亲缘关系最近.半定量RT-PCR的结果显示,该基因在组织中广泛表达且在肝胰腺中表达量最高,在眼柄中表达最低;其在经桃拉综合征病毒(TSV)感染后的凡纳滨对虾肝胰腺中的表达量显著高于在无特定病原(SPF)凡纳滨对虾;加之ProtFun在线预测蛋白质的功能分类,表明Arf6基因可能是一免疫应答因子参与凡纳滨对虾免疫防御反应. |
| 关 键 词： | 凡纳滨对虾 RT-PCR 基因克隆 Arf6 |
Molecular cloning and expression analysis of Arf6 in Litopenaeus vannamei |
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| CUI Liang,YIN Qin,CHEN Xiao-han,PENG Jin-xia,WANG Zhi-wei,LI Kui. Molecular cloning and expression analysis of Arf6 in Litopenaeus vannamei[J]. Progress in Fishery Sciences, 2011, 32(2): 60-65 | |
| Authors: | CUI Liang YIN Qin CHEN Xiao-han PENG Jin-xia WANG Zhi-wei LI Kui |
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| Keywords: | |
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