| DDRT-PCR技术分析籽粒苋镉胁迫下相关基因的差异表达 |
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| 引用本文： | 晋海军,胡洪利,陈惠,张世熔,吴琦,孙蓉,唐自钟.DDRT-PCR技术分析籽粒苋镉胁迫下相关基因的差异表达[J].农业环境科学学报,2015,34(9):1659-1664. |
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| 作者姓名： | 晋海军 胡洪利 陈惠 张世熔 吴琦 孙蓉 唐自钟 |
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| 作者单位： | 四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014,四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014,四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014,四川农业大学环境学院, 成都 611130,四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014,四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014,四川农业大学生命科学学院, 四川 雅安 625014 |
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| 摘 要： | 以镉污染修复植物籽粒苋(Amaranthus hypochondriacus)的根、叶、果为实验材料,利用DDRT-PCR技术分析籽粒苋Cd胁迫下基因表达水平的变化。结果表明:回收差异片段获得镉处理诱导的4个差异表达序列(EST-1、EST-2、EST-3和EST-4),经Blastn比对,EST-1与土人参26S核糖体RNA基因部分序列(GB|HQ843466.1)一致性为99%,EST-2与虎耳草26S核糖体RNA大亚基基因部分序列(GB|AF036498.1)一致性为93%,EST-3与大肠杆菌菌株TW14359 DNA聚合酶Ⅲα亚基基因(ECs0186)完整CDS(GB|EU906049.1)一致性为97%,EST-4与米曲霉RIB40 β-葡萄糖苷酶基因(XM_001816779.2)一致性为99%;经Blastx比对,EST-1与假定蛋白MTR_5g051030苜蓿](XP_003614386.1)氨基酸序列相似性为26%,EST-2与假定衰老相关蛋白柏杉](GB|ACA30301.1)氨基酸序列一致性为98%,EST-3与DNA聚合酶Ⅲα亚基 大肠杆菌OP50](ZP_06935700.1)氨基酸序列一致性为100%,EST-4与β-葡萄糖苷酶黄曲霉NRRL3357](XP_002383240.1)氨基酸序列一致性为99%;4个差异表达基因通过调控蛋白质代谢、DNA复制和糖代谢等途径来应答镉胁迫。
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| 关 键 词： | 籽粒苋 镉胁迫 DDRT-PCR技术 |
| 收稿时间： | 2015/5/24 0:00:00 |
Analysis of Differentially Expressed Genes of Amaranthus hypochondriacus Under Cadmium Stress by DDRT-PCR |
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| JIN Hai-jun,HU Hong-li,CHEN Hui,ZHANG Shi-rong,WU Qi,SUN Rong and TANG Zi-zhong.Analysis of Differentially Expressed Genes of Amaranthus hypochondriacus Under Cadmium Stress by DDRT-PCR[J].Journal of Agro-Environment Science( J. Agro-Environ. Sci.),2015,34(9):1659-1664. |
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| Authors: | JIN Hai-jun HU Hong-li CHEN Hui ZHANG Shi-rong WU Qi SUN Rong and TANG Zi-zhong |
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| Institution: | College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China,College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China,College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China,College of Environmental Sciences, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China,College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China,College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China and College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya'an 625014, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Amaranthus hypochondriacus cadmium stress DDRT-PCR |
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