洋葱转录组测序及黄酮类化合物合成相关基因的分析

洋葱是世界范围内种植的重要蔬菜作物，其鳞茎颜色是洋葱选育和食用的重要性状。本研究对紫皮洋葱和黄皮洋葱进行高通量转录组测序，挖掘黄酮类化合物合成的基因，探讨不同皮色形成的分子基础。本研究共获得5 809个差异表达基因，包括2 991个上调表达基因，2 818个下调表达基因。差异基因GO功能富集分析显示，差异基因主要参与细胞组分、生物过程和分子功能3大类。KEGG显著富集分析显示，差异表达基因主要富集在3条代谢途径上。黄酮类化合物合成相关的通路有类黄酮合成途径、花青素合成途径、异黄酮合成途径、黄酮和黄酮醇合成途径，并筛选出了F3’H、FLS、CHI和DFR等黄酮类合成相关的结构基因。本研究为进一步探讨洋葱皮色相关的代谢合成途径关键酶的功能及其调控机制提供了基础。