蓖麻RcPIPs基因家族的鉴定与生物信息学分析

PIP基因家族是AQP基因家族中的一个亚家族，家族基因广泛参与运输水分及其他小分子、响应各种非生物胁迫、参与植物的开花与生长、气孔活动、种子萌发。本研究主要以蓖麻(大戟科)为材料，基于蓖麻基因组数据库，进行蓖麻PIP基因家族筛选及生物信息学分析。结果表明，共筛选出10个PIP基因成员，且不同蛋白质序列和特性都存在较大差异；基因结构分析结果表明，除了RcPIP10具有3个外显子，其余的都具有4个外显子，motif 1、motif 2、motif 5、motif 8是蓖麻PIP基因的特征基序；系统进化树结果表明，RcPIPs基因分成2个亚族且每个亚族均有5个基因，其中有2对基因在进化关系上成对出现，表现出较高的同源性；跨膜结构预测结果表明，蛋白RcPIP1～RcPIP9均有6个跨膜结构域，而RcPIP10仅有4个跨膜结构域，证实蓖麻家族PIPs大部分具有MIP超家族典型的跨膜螺旋特征；基因定位显示，10个基因不均匀的分布到9条染色体上，有8条染色体各分布1个RcPIP基因，仅有1条染色体分布2个RcPIPs基因。本研究结果不仅为大戟科植物和其他植物的PIP基因的功能分析和利用提供了有价值的...