小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定 |
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引用本文: | 赵思航,刘昊东,徐渴,张树华,赵勇,杨学举.小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定[J].分子植物育种,2023(1):27-35. |
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作者姓名: | 赵思航 刘昊东 徐渴 张树华 赵勇 杨学举 |
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作者单位: | 河北农业大学华北作物改良与调控国家重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31901539);;河北省科技计划项目(16226320D)共同资助; |
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摘 要: | MicroRNA (MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-qPCR结合RNA-seq数据明确MIR160s在不同小麦组织的表达模式,利用降解组测序和5’RLM-RACE技术验证小麦中MIR160s与靶基因的靶向关系。结果表明,MIR160s成熟体的序列在32个植物物种中高度保守,仅在第15和21位碱基存在多样性;小麦中MIR160s成员分别定位于1、5、6和7号染色体上;Tae-MIR160s成熟体在成熟叶片中表达量较高,其中Tae-MIR160c表达量最低;Tae-MIR160s分别可以在第1 716、1 562、1 305和1 931位碱基靶向切割TaARF11、TaARF25、TaARF34、TaARF54生长素响应因子(Auxin response factor)。本研究通过揭示Tae-MIR160s的进化规律、表达模式和靶基因,为小麦中MIR160s应答响应机制的解析提供了...
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关 键 词: | 小麦 Tae-MIR160s 进化规律 靶基因 |
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