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小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定
引用本文:赵思航,刘昊东,徐渴,张树华,赵勇,杨学举.小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定[J].分子植物育种,2023(1):27-35.
作者姓名:赵思航  刘昊东  徐渴  张树华  赵勇  杨学举
作者单位:河北农业大学华北作物改良与调控国家重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目(31901539);;河北省科技计划项目(16226320D)共同资助;
摘    要:MicroRNA (MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-qPCR结合RNA-seq数据明确MIR160s在不同小麦组织的表达模式,利用降解组测序和5’RLM-RACE技术验证小麦中MIR160s与靶基因的靶向关系。结果表明,MIR160s成熟体的序列在32个植物物种中高度保守,仅在第15和21位碱基存在多样性;小麦中MIR160s成员分别定位于1、5、6和7号染色体上;Tae-MIR160s成熟体在成熟叶片中表达量较高,其中Tae-MIR160c表达量最低;Tae-MIR160s分别可以在第1 716、1 562、1 305和1 931位碱基靶向切割TaARF11、TaARF25、TaARF34、TaARF54生长素响应因子(Auxin response factor)。本研究通过揭示Tae-MIR160s的进化规律、表达模式和靶基因,为小麦中MIR160s应答响应机制的解析提供了...

关 键 词:小麦  Tae-MIR160s  进化规律  靶基因
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