ClaMADS12基因克隆及在西瓜果实发育中的表达特性分析

本研究从西瓜果实发育转录组数据中，筛选出ClaMADS12基因，并对其进行基因克隆、生物信息学以及初步表达分析。生物信息学分析显示该基因的开放阅读框为3 374 bp，编码区全长621 bp，共编码206个氨基酸。结构域分析显示，该基因含有一个典型的“MADS-box”保守结构域，位于从N端第1到75个氨基酸，属于MADS-box家族。对其蛋白质的理化性质分析显示，ClaMADS12蛋白以异亮氨酸为主，无信号肽和跨膜结构域，属于不稳定型、亲水蛋白，亚细胞定位预测该蛋白位于细胞核。对该基因进行同源性比对及系统进化树分析显示，冬瓜MADS-box 12基因与ClaMADS12亲缘关系最近，同源性高达95.61%。RT-PCR分析表明，ClaMADS12在西瓜果实发育中，相对表达量与果肉质地的软化呈正相关。本研究为进一步明确ClaMADS12基因在西瓜果实发育中的功能提供依据。