番茄Trihelix基因家族生物信息学分析

Trihelix家族在植物生长发育和应对非生物胁迫中具有关键的作用。为明确Trihelix家族成员的基本特征，本研究运用生物信息学方法在番茄全基因组数据库中鉴定出36个Trihelix家族成员。利用生物软件对番茄Trihelix家族成员进行全面的分析，包括理化性质分析、亚细胞定位、二级结构分析、三级结构预测、启动子顺式作用元件预测、组织特异性分析。根据亲缘关系分为6个亚家族，基于MEME进行的保守基序分析与聚类分析具有一致性。研究初步解析番茄Trihelix家族成员的结构与功能，为进一步明确番茄Trihelix家族转录因子的系统发育和生物学功能提供基础。