金花葵不同组织的转录组测序及分析

为了获得金花葵转录组信息，研究其功能基因的表达，本试验采用Illumina Hiseq 2500转录组高通量测序技术对金花葵不同组织的转录组进行测序，从差异表达基因中鉴定与黄酮类化合物合成的相关基因。研究结果表明，共获得97.64 Gb有效数据，各样品有效数据均为5.81 Gb,Q30碱基百分比在92.73%及以上。经过组装后共获得52 990条Unigene，其中39 651条被注释。通过KEGG分析，发现不同组织中黄酮类化合物生物合成的基因表达均有较大的变化。检测出单碱基重复至六碱基重复类型的SSR位点4 322个。本试验分析了金花葵各组织参与黄酮类化合物合成的相关基因，为进一步研究金花葵次生代谢产物合成的功能基因挖掘与利用提供充足的理论依据。