15个马铃薯AP2/ERF转录因子的生物信息学与表达分析 |
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引用本文: | 赵营,刘维刚,李世贵,张宁,司怀军.15个马铃薯AP2/ERF转录因子的生物信息学与表达分析[J].分子植物育种,2023(9):2806-2815. |
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作者姓名: | 赵营 刘维刚 李世贵 张宁 司怀军 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院;2. 甘肃农业大学甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地;3. 甘肃农业大学农学院 |
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摘 要: | AP2/ERF (APETALA2/ethylene-responsive factor)是植物中的一大类转录因子,其参与非生物胁迫反应、激素应答、植物生长、花发育、种子发育、损伤响应、病菌防御、耐高盐等多种生物学过程,为了初步阐明该转录因子在马铃薯胁迫响应中的功能,本研究对15个马铃薯StERF基因进行了生物信息学和表达分析。结果表明,15个马铃薯StERFs转录因子除St ERF3、StERF10、St ERF12、StERF120仅具有WLG结构域外,其余11个均具有YRG和WLG结构域,在进化上可分为3个亚家族(AP2, ERF和RAV)。对15个StERFs基因上游2 000 bp启动子区的顺式作用元件分析发现,其包含ABRE、CGTCA-motif、TGACG-motif和TCAelement等响应元件。RT-qPCR分析结果表明马铃薯StERFs基因在聚乙二醇(PEG-6000)、乙烯、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和甘露醇等处理下表达模式不同,StERF79、StERF72在5种处理下均上调表达,StERF156,StERF5在水杨酸和甘露醇胁迫处理下均上调表达...
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关 键 词: | 马铃薯 ERFs基因 生物信息学分析 表达分析 |
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