红肉枇杷(Eriobotrya japonica)伸展蛋白基因家族的全基因组鉴定与分析

伸展蛋白(extensin, EXT)属于富含羟脯氨酸的糖蛋白(hydroxyproline-rich glycoprotein, HRGP)的一类，是细胞壁中的一种结构蛋白，在植物的生长中发挥多种作用。本研究在枇杷基因组中进行了EXT基因家族的全基因组鉴定，从所有枇杷蛋白编码基因中鉴定到112个EXT序列。根据结构域的类型、特征基序的数量和信号肽的有无，将112个EXT序列分为8类，包括6个经典的EXT (classical EXT, CEXT)、8个formin同源EXT (formin homolog (FH) chimeric EXT, FH EXT)、6个富含亮氨酸重复序列的嵌合EXT (leucine-rich repeat (LRR) chimeric EXT, LRX)、14个富含脯氨酸的EXT类受体激酶(proline-rich EXT-like receptor kinase,PERK)、9个短EXT (short EXT, SEXT)、1个长嵌合EXT (long chimeric EXT, LEXT)、56个其他嵌合EXT (other chimeric EXT...