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菠萝乌头酸酶家族基因鉴定及其表达分析
引用本文:陈景秀,朱祝英,付琼,吴青松,姚艳丽,刘胜辉,陆新华,张红娜,高玉尧,张秀梅.菠萝乌头酸酶家族基因鉴定及其表达分析[J].分子植物育种,2023(21):7016-7024.
作者姓名:陈景秀  朱祝英  付琼  吴青松  姚艳丽  刘胜辉  陆新华  张红娜  高玉尧  张秀梅
作者单位:1. 海南大学园艺学院;2. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
基金项目:海南省自然科学基金高层次人才项目(2019RC287);;国家重点研发计划项目(2020YFD100604);
摘    要:为了探究菠萝乌头酸酶家族基因在柠檬酸代谢中的作用,本研究系统鉴定了AcACOs家族基因及其生物学分析,共鉴定了6个菠萝乌头酸酶基因。根据构建系统进化树结果表明,单子叶植物与菠萝乌头酸酶基因家族亲缘关系更近,将6个成员命名为AcACO1~AcACO6;AcACOs理化性质分析结果表明,菠萝乌头酸酶家族基因差异较大,亚细胞定位均定位在线粒体;通过全基因组GFF注释文件,对其外显子-内含子结构进行分析,结果表明Ac ACOs家族成员均含有一个或多个外显子;可视化该家族成员种间进化关系、motif和基因结构分析结构,表明AcACOs可分成3个亚组,AcACO4、AcACO5和AcACO6属同一类群,为类群Ⅰ;AcACO1和AcACO2归属同一类群,为类群Ⅱ,AcACO3单独为一类群,为类群Ⅲ;基因组定位结果显示菠萝ACO家族基因共分布在5条不同的染色体中。联合单子叶和双子叶植物ACOs基因作了系统进化分析,采用邻接法(neighbor joining, NJ),其结果显示,AcACOs与大多数单子叶植物聚为一类;顺式作用元件预测分析结果表明,AcACOs含有数量较多的光响应元件和胁迫响应元件。...

关 键 词:菠萝(Ananas  comosus  L.)  乌头酸酶  基因家族  表达分析
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