菠萝乌头酸酶家族基因鉴定及其表达分析 |
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引用本文: | 陈景秀,朱祝英,付琼,吴青松,姚艳丽,刘胜辉,陆新华,张红娜,高玉尧,张秀梅.菠萝乌头酸酶家族基因鉴定及其表达分析[J].分子植物育种,2023(21):7016-7024. |
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作者姓名: | 陈景秀 朱祝英 付琼 吴青松 姚艳丽 刘胜辉 陆新华 张红娜 高玉尧 张秀梅 |
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作者单位: | 1. 海南大学园艺学院;2. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 |
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基金项目: | 海南省自然科学基金高层次人才项目(2019RC287);;国家重点研发计划项目(2020YFD100604); |
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摘 要: | 为了探究菠萝乌头酸酶家族基因在柠檬酸代谢中的作用,本研究系统鉴定了AcACOs家族基因及其生物学分析,共鉴定了6个菠萝乌头酸酶基因。根据构建系统进化树结果表明,单子叶植物与菠萝乌头酸酶基因家族亲缘关系更近,将6个成员命名为AcACO1~AcACO6;AcACOs理化性质分析结果表明,菠萝乌头酸酶家族基因差异较大,亚细胞定位均定位在线粒体;通过全基因组GFF注释文件,对其外显子-内含子结构进行分析,结果表明Ac ACOs家族成员均含有一个或多个外显子;可视化该家族成员种间进化关系、motif和基因结构分析结构,表明AcACOs可分成3个亚组,AcACO4、AcACO5和AcACO6属同一类群,为类群Ⅰ;AcACO1和AcACO2归属同一类群,为类群Ⅱ,AcACO3单独为一类群,为类群Ⅲ;基因组定位结果显示菠萝ACO家族基因共分布在5条不同的染色体中。联合单子叶和双子叶植物ACOs基因作了系统进化分析,采用邻接法(neighbor joining, NJ),其结果显示,AcACOs与大多数单子叶植物聚为一类;顺式作用元件预测分析结果表明,AcACOs含有数量较多的光响应元件和胁迫响应元件。...
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关 键 词: | 菠萝(Ananas comosus L.) 乌头酸酶 基因家族 表达分析 |
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