基于全基因组重测序鉴定四株金针菇线粒体序列差异

在真核细胞中，线粒体是氧化磷酸化的发生部位。它广泛存在于生物体中，具有独立的遗传物质DNA，能够参与细胞质遗传。目前金针菇线粒体基因组已经被解析，但其在不同菌株中的多态性仍未见报道。本研究结合已经公布的金针菇菌株4019-20线粒体基因组，组装和注释了重测序的3株金针菇(6-3,6-21, L22)线粒体序列。基因组比较分析表明：金针菇线粒体基因组长度在87 646～88 508 bp，编码蛋白数量均为15个，编码tRNA数目为26个，编码rRNA大亚基和小亚基的基因各1个。除4019-20菌株含有9个内含子外，其余菌株均含有10个内含子。进一步对四株金针菇线粒体基因组结构共线性分析，结果表明，在4个菌株中含有4个差异片段，其中差异片段Ⅰ为cox1基因第4内含子(菌株4019-20缺失)。同时，我们还检测到金针菇线粒体基因组中有两个片段存在移位现象，在移位位点处存在～1.6 kb和～2.8 kb的多态性片段。本研究结果能为金针菇线粒体基因组结构和遗传特性研究提供一定数据基础。