银杏褐化与非褐化愈伤组织的转录组分析

本研究利用环境扫描电子显微镜和高通量测序技术对银杏褐化和非褐化愈伤组织进行细胞结构观察与转录组测序，以探索愈伤组织的褐化机理。扫描电镜观察显示非褐变的愈伤组织细胞排列均匀，褐变愈伤组织的细胞表现出紊乱，排列松散无序。对褐化和非褐化愈伤组织共计6个样品进行了转录组测序，共获得45.66 Gb Clean Reads，各样品Clean Reads均达到6.41 Gb以上。对褐化与非褐化愈伤组织的基因进行差异分析，结果发现分别有275和153个基因上调和下调表达。转录因子分析发现相较于非褐化愈伤组织，褐化愈伤组织中MYB、AP2和NAC等转录因子表达量上调，HD-ZIP下调。KEGG功能富集分析结果表明差异表达基因显著富集在苯丙烷代谢途径，PAL和CCR基因上调表达增加了酚酸的合成与代谢，推测苯丙烷生物代谢途径部分基因表达量上调导致酚酸类化合物的积累，可能是银杏愈伤组织褐化的主要原因。本研究通过扫描电镜观察和转录组测序，为解析银杏愈伤组织褐化的分子机制提供理论依据。