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| 青花菜全长转录组测序分析 | |
| 作者姓名： | 裴徐梨 胡文婷 杨云美 荆赞革 唐征 |
| 作者单位： | 1. 昆明学院农学与生命科学学院;2. 温州科技职业学院农业与生物技术学院 |
| 基金项目： | 浙江省自然科学基金项目(No.LY18C-150006)；;浙江省“十四五”农业新品种选育重大科技专项(中晚熟青花菜新品种选育)；;温州市科技项目(No.2019ZX007-2)共同资助； |
| 摘 要： | 青花菜(Brassica oleracea L. var. italica)为十字花科芸薹属甘蓝种作物，具有较高的经济和营养价值。本试验对青花菜自交系进行全长转录组测序，获得非冗余转录本24 365条，预测出20 399个完整CDS区，检索到17 116个SSR位点，多数SSR属单核苷酸类型(45%)。非冗余转录本注释结果表明有24 173个(99.21%)转录本被成功注释。NR数据库中注释为甘蓝型油菜(Brassica napus)的相关基因数最多(70.63%)，其次为白菜型油菜(Brassica rapa)(25.07%)。GO数据库中有22 584个(92.69%)转录本被成功注释，可分为细胞组成、分子功能、生物过程3大类。COG数据库中有10 880个(44.65%)转录本得到注释，分为25大类。KEGG代谢途径分析中，有10 439个(42.84%)转录本被注释，分布在126条代谢通路中。本研究结果可丰富及深化青花菜转录组信息，也为重要农艺性状定位、生长发育调控机理、抗性机制等方面的研究提供重要的数据支持。 |
| 关 键 词： | 青花菜 全长转录组 SSR 功能注释 |