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漆树查尔酮合酶基因家族生物信息学分析
引用本文:孔娇,黄晓华,赵爱国.漆树查尔酮合酶基因家族生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(20):6698-6704.
作者姓名:孔娇  黄晓华  赵爱国
作者单位:西北农林科技大学林学院
基金项目:陕西省自然科学基金项目(2021JM-096)资助;
摘    要:查尔酮合酶(CHS)是黄酮类化合物合成过程中的关键酶。为了进一步探索CHS基因家族在调控黄酮类物质合成中的功能,本研究对12个漆树CHS基因编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、蛋白二级结构以及系统进化等方面进行初步生物信息学分析。保守结构域分析发现12个TvCHS基因均含有CHS-Like保守序列;12个TvCHS基因除了TvCHS10在叶中不表达和TvCHS11在根中不表达,其余10个基因在漆树根茎叶都有表达;12个CHS蛋白中有4个疏水蛋白、8个亲水蛋白。在系统进化分析中,漆树CHS基因家族12个基因被划分为两个组。信号肽预测分析发现12个TvCHS基因均为非分泌蛋白;磷酸化位点预测分析发现丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点数量最多,络氨酸最少。本研究对漆树CHS基因家族进行鉴定和分析,为进一步研究漆树CHS基因家族的功能提供了一定的参考和依据。

关 键 词:漆树  查尔酮合酶基因家族  生物信息学分析
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