春兰DUF3598家族CgDUF1基因的克隆与生物信息学分析

DUF3598是一类具有未知功能结构域的基因家族，在植物的生长发育和响应逆境胁迫中可能扮演重要角色，为了研究DUF3598蛋白对春兰的调控作用，初步探讨其生物学功能，本试验以春兰为实验材料，采用RT-PCR的方法，克隆获得一段长为1 245 bp的ORF序列，暂命名为CgDUF1，并进行生物信息学预测分析。结果表明，CgDUF1基因共编码20种氨基酸，无信号肽和跨膜结构域，属于非分泌性的亲水蛋白，预测该蛋白主要定位于叶绿体中。系统发育分析表明，CgDUF1蛋白与拟南芥DUF3598蛋白：A0A384KT89的亲缘关系最近。高级结构预测表明CgDUF1蛋白由3种二级结构组成，其中无规则卷曲占比最高，为54.59%。本研究为春兰DUF3598基因家族的生物学功能的研究提供了依据。