人参PgPP2C2基因的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 梁浩,张亚玉,孙海,李美佳,张正海,邵财,王莹.人参PgPP2C2基因的克隆及生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(16):5221-5230. |
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作者姓名: | 梁浩 张亚玉 孙海 李美佳 张正海 邵财 王莹 |
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作者单位: | 1. 中国农业科学院特产研究所,吉林省中药材种植(养殖)重点实验室;2. 成都大学药学与生物工程学院 |
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基金项目: | 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系项目(CARS-21); |
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摘 要: | 2C型蛋白磷酸酶(PP2C)是最大的蛋白磷酸酶家族,PP2C蛋白在响应不同非生物胁迫中发挥着重要作用。为了探究人参Pg PP2C2基因的功能,基于实验室前期转录组数据库,从人参中克隆了一个2C型蛋白磷酸酶基因,命名为Pg PP2C2,并对Pg PP2C2基因的序列、编码蛋白质的结构进行分析,预测了其功能。研究结果表明,该核苷酸序列的开放阅读框为1 269 bp,编码422个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白,无信号肽,未形成跨膜结构域,包含2C家族丝氨酸/苏氨酸磷酸酶催化结构域。通过蛋白互作分析,发现Pg PP2C2蛋白与HOG1 (参与渗透调节的丝裂原活化蛋白激酶)和NBP2 (NAP1-binding蛋白2,参与HOG途径的蛋白)的互作分数分别高达0.996和0.984,推测Pg PP2C2蛋白可能参与渗透胁迫调节及磷酸化过程。本研究结果可为后期进一步研究PgPP2C2基因的功能和开展人参种植调控提供理论基础。
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关 键 词: | 人参(Panax ginseng) PP2C2基因 生物信息学分析 |
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