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甘薯扩展蛋白IbEXPA2基因克隆和表达分析
作者姓名:蔡兆琴  龙婷晞  肖冬  王爱勤  黄咏梅  李慧峰  詹洁  何龙飞
作者单位:1. 广西大学农学院植物科学国家级实验教学示范中心;2. 广西大学广西农业环境与农产品安全重点实验室;3. 广西农业科学院玉米研究所
基金项目:国家自然科学基金项目(32060419);
摘    要:扩展蛋白(Expansin)是细胞壁的重要组成成分,参与细胞壁的舒张,与植物器官生长发育密切相关。甘薯是一种块根类作物,其块根不仅是繁殖器官,也是储能器官,因此,开展甘薯块根生长膨大机理研究具有重要意义。本研究在前期转录组学研究基础上,克隆到一个可能与块根膨大相关的扩展蛋白基因IbEXPA2,并进行生物信息学和qPCR表达分析。生物信息分析表明,IbEXPA2编码253个氨基酸,包含DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域,具有一段信号肽及23个氨基酸的跨膜结构域。该基因编码的蛋白与三裂叶薯expansin-A4蛋白(登录号:XP_031109781.1)的同源性最高,为98.03%;时空表达分析表明该基因在甘薯品种‘西瓜红’和‘桂经薯8号’块根中表达显著高于纤维根,‘西瓜红’生长的各个时期块根中表达均显著高于茎和叶,在移栽50 d时表达量最高,为对照纤维根的8.49倍;‘桂经薯8号’生长多数时期在块根中的表达也显著高于茎和叶,在移栽35 d时表达量最高,为对照的8.11倍。推测该基因参与甘薯块根生长膨大调控。

关 键 词:扩展蛋白  生信分析  表达分析  块根  甘薯
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