玉米籽粒颜色全基因组关联分析

籽粒颜色是玉米重要的性状之一，籽粒色素影响玉米的营养价值和商品品质，解析其遗传机制对玉米优良种质选育至关重要。本研究以244份玉米优良自交系为材料，分析其籽粒颜色的遗传变异规律，并利用覆盖玉米全基因组的913万个SNP标记，开展籽粒颜色的全基因组关联分析，以期初步解析玉米籽粒颜色的遗传学基础。结果显示，共检测到258个SNP位点与玉米籽粒颜色性状紧密关联，其中与Level、R、G、B、Gray和RGB性状显著关联的SNP位点(Sig SNP)分别有27、11、7、197、5和11个，且有6个位点/区间(meta SNP)被至少2个性状同时定位到。所有显著性SNP位点附近共定位到482个候选基因，其中37个候选基因位于meta SNP区域，控制玉米黄白粒的Y1基因和类胡萝卜素合成的DXS3基因被籽粒颜色B值定位到。本研究结果可为进一步筛选控制籽粒颜色的基因和指导籽粒颜色选择育种提供理论基础。