百脉根WRKY基因家族生物信息学分析

WRKY转录因子是一个超家族的调节因子，参与植物的多种生物过程和逆境胁迫反应。然而，在百脉根中对WRKY家族还没有相关的研究。本研究共鉴定出79个LjWRKYs基因，它们不均匀分布在各染色体上的基因位点编码，与拟南芥At WRKYs进行系统发育分析，分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类。保守基序和外显子-内含子数目表明79个LjWRKYs在不同亚簇中均具有较大的差异，顺式作用元件结果显示在上游2 000 bp启动子区域包含多种逆境胁迫、激素和生长发育相关的元件。共线性结果有36对片段复制和1对串联重复复制共线性基因，且Ka/Ks均小于1。本研究通过分析百脉根WRKY基因家族的基本结构与性质，为深入研究百脉根WRKY基因家族提供了基础。