水稻SAUR23基因的生物信息学分析及其CRISPR/Cas9基因编辑载体的构建 |
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引用本文: | 贾辰昊,张昊,仝骁鹏,田雨冰,王唯先,裴忠有.水稻SAUR23基因的生物信息学分析及其CRISPR/Cas9基因编辑载体的构建[J].分子植物育种,2023(7):2110-2115. |
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作者姓名: | 贾辰昊 张昊 仝骁鹏 田雨冰 王唯先 裴忠有 |
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作者单位: | 天津农学院农学与资源环境学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划“七大农作物育种”专项(2017YFD0100506); |
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摘 要: | 为探索水稻SAUR23基因在水稻生长发育过程中发挥的作用,本研究利用生物信息学分析发现,OsSAUR23编码区长462 bp,编码153个氨基酸,相对分子量为16.89 kD,理论等电点为10.04,是一种不稳定的、亲水性的、非跨膜不分泌蛋白,属于水稻SAUR基因家族的一员;二级结构预测发现Os SAUR23蛋白以无规则卷曲和α-螺旋为主。此外,利用CRISPR-GE在线网站设计一对sg RNA序列,采用自然降温的方法获得双链sg RNA,并在T4连接酶的作用下与线性化载体p HSN401相连,经过菌落PCR以及测序验证表明,针对水稻SAUR23基因的CRISPR/Cas9基因编辑载体构建成功。随后,将其转入农杆菌,为遗传转化水稻获得水稻OsSAUR23基因的基因编辑突变体提供实验材料。
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关 键 词: | SAUR CRISPR/Cas9 水稻 生物信息学分析 |
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